摘要:當(dāng)數(shù)據(jù)發(fā)生變化時,這種演變過程隨之發(fā)生。是一種統(tǒng)計報告圖,由一系列高度不等的縱向條紋或線段表示數(shù)據(jù)分布的情況。
python相關(guān) 基礎(chǔ)概念
數(shù)據(jù):離散的,客觀事實的數(shù)字表示
信息:處理后的數(shù)據(jù),為實際問題提供答案
- 為數(shù)據(jù)提供一種關(guān)系或一個關(guān)聯(lián)后,數(shù)據(jù)就成了信息,這種關(guān)聯(lián)通過提供數(shù)據(jù)背景來完成
知識: 是數(shù)據(jù)、信息和通過經(jīng)驗獲得的技能
- 知識包括做出適當(dāng)決策的能力和執(zhí)行時所需的技能
觀點:
- 如何獲取觀點: 基于已有數(shù)據(jù)信息得到最佳或現(xiàn)實的決策,我們可以通過數(shù)據(jù)分析
數(shù)據(jù)分析 依賴數(shù)學(xué)算法來確定產(chǎn)生觀點的數(shù)據(jù)之間的關(guān)系
信息是可量化的、可測度的、有形式的,可被訪問、生成、存儲、分發(fā)、搜索、壓縮和復(fù)制。
信息可以通過數(shù)量或信息量進(jìn)行量化。,信息可轉(zhuǎn)換為知識,知識要比信息更量化。在某些領(lǐng)域,知識持續(xù)經(jīng)歷一個不斷發(fā)展周期。當(dāng)數(shù)據(jù)發(fā)生變化時,這種演變過程隨之發(fā)生。
通過離散算法
數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換:數(shù)據(jù)被轉(zhuǎn)換成信息,得到進(jìn)一步處理,然后用來解決問題
- 數(shù)據(jù)的種類不同,包括表現(xiàn)數(shù)據(jù), 實驗數(shù)據(jù),基準(zhǔn)數(shù)據(jù)
可視化的整個過程需要不用技能和專業(yè)領(lǐng)域的人。
數(shù)據(jù)工人努力收集數(shù)據(jù)并完成分析
數(shù)學(xué)家和統(tǒng)計學(xué)家理解可視化設(shè)計原則,并用這些原則完成數(shù)據(jù)交流
設(shè)計師和藝術(shù)家和開發(fā)者具備可視化轉(zhuǎn)換的技能
業(yè)務(wù)分析員等找尋行為模式,離群點或突發(fā)趨勢
整個過程額步驟是:
獲取或收集數(shù)據(jù):
解析和過濾數(shù)據(jù):用編程方法進(jìn)行解析、清洗和減少數(shù)據(jù)
分析提煉數(shù)據(jù): 刪除噪音和一些不必要維度,發(fā)展模式
呈現(xiàn)和交互 用更容易得到和理解的方式展示數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)預(yù)處理數(shù)據(jù)清洗:用于數(shù)據(jù)的噪音清理和矛盾糾正
數(shù)據(jù)集成:將多個數(shù)據(jù)源的數(shù)據(jù)合并起來(倉庫)
數(shù)據(jù)壓縮:通過合并、聚集、消除冗余特征等方法減少數(shù)據(jù)量
數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換:將數(shù)據(jù)縮放到一個較小的區(qū)間,從而提高處理和可視化的精確性和效率
提取數(shù)據(jù) -> 刪除不一致數(shù)據(jù) ->重建缺失數(shù)據(jù) ->數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化 -> 驗證數(shù)據(jù)
-
數(shù)據(jù)處理 數(shù)據(jù)集資源 數(shù)據(jù)分析與可視化這里我們會使用下面幾種繪圖工具
matplotlib: 是一個最基礎(chǔ)的Python可視化庫,作圖風(fēng)格接近MATLAB,所以稱為matplotlib。一般都是從matplotlib上手Python數(shù)據(jù)可視化,然后開始做縱向與橫向拓展
Seaborn:是一個基于matplotlib的高級可視化效果庫,針對的點主要是數(shù)據(jù)挖掘和機(jī)器學(xué)習(xí)中的變量特征選取,seaborn可以用短小的代碼去繪制描述更多維度數(shù)據(jù)的可視化效果圖
Plotly: 繪圖工具,是建立在一個開放源碼庫plotly.js上,由一家擁有多種產(chǎn)品和開源工具的
Pyecharts : 是基于百度echarts的一個開源項目,也是我目前接觸到的最容易實現(xiàn)交互可視化的工具,相比bokeh和plotly,pyecharts的語法更簡單,實現(xiàn)效果更佳出眾(做過前端的對這個應(yīng)該很了解)
Bokeh: 是一個用于做瀏覽器端交互可視化的庫,實現(xiàn)分析師與數(shù)據(jù)的交互
pandas: 是基于NumPy 的一種工具,該工具是為了解決數(shù)據(jù)分析任務(wù)而創(chuàng)建的。Pandas 納入了大量庫和一些標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)模型,提供了高效地操作大型數(shù)據(jù)集所需的工具。
Mapbox: 處理地理數(shù)據(jù)引擎更強(qiáng)的可視化工具庫
geoplotlib
cufflinks: a library for easy interactive Pandas charting with Plotly
圖形公司創(chuàng)造并提供免費(fèi)使用,我們可以在離線模式下創(chuàng)建無限圖表,在線模式下最多可以創(chuàng)建25個圖表
當(dāng)然,找更多工具戳這里
數(shù)據(jù)的可視化是表達(dá)信息的過程,在可視化化過程我們要思考:
要處理多少變量?我們試圖畫出怎樣的圖像?
x軸和y軸指代什么?(三維圖中有z軸)
數(shù)據(jù)的大小是否被標(biāo)準(zhǔn)化?數(shù)據(jù)點的大小意味著什么?
我們的選色對嗎?
對于時間序列數(shù)據(jù),我們是否試圖識別趨勢或相關(guān)性
這里有個學(xué)生數(shù)據(jù):http://www.knapdata.com/pytho...
# -*- coding:utf-8 -*- # usr/bin/python 3.5+ import pandas as pd import seaborn as sns import matplotlib.pyplot as plt students = pd.read_csv("data/ucdavis.csv") g = sns.FacetGrid(students, hue="gender", palette="Set1", size=6) g.map(plt.scatter, "gpa", "computer", s=250, linewidth= 0.65, edgecolor="white") g.add_legend() plt.show()
seaborn: http://seaborn.pydata.org/api...
FacetGrid 類可以刻畫三個維度: 行、列、色調(diào)
- 用于對數(shù)據(jù)子集中的一個變量的分布或者多個變量關(guān)系進(jìn)行可視化
barchartmatplotlib.pyplot.bar
import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt N = 7 winnersplot = (142.6, 125.3, 62.0, 81.0, 145.6, 319.4, 178.1 ) ind = np.arange(N) width = 0.35 fig, ax = plt.subplots() winners = ax.bar(ind, winnersplot, width, color="#ffad00") print(winners) nomineesplot = (109.4, 94.8, 60.7, 44.6, 116.9,262.5,102.0) nominees = ax.bar(ind + width, nomineesplot, width, color="#9b3c38") # add some text for labels ,title and axes ticks ax.set_xticks(ind+width) ax.set_xticklabels(("小明", "小紅", "小凡", "小錢", "小劉", "小趙", "小文")) ax.legend((winners[0], nominees[0]),("奧斯卡金獎得住","奧斯卡得住提名")) def autolabel(rects): # attach some text labels for rect in rects: height = rect.get_height() hcap = "$" + str(height) + "M" ax.text(rect.get_x() + rect.get_width()/2. ,height, hcap,ha = "center",va="bottom",rotation="horizontal") autolabel(winners) autolabel(nominees) plt.show()piechart
matplotlib.pyplot.pie
import matplotlib.pyplot as plt labels = "Computer Science", "Foreign Languges","Analytical Chemistry", "Education", "Humanities", "Physics", "Biology", "Math and Statistics", "Engineering" sizes = [21, 4, 7, 7, 8, 9, 10, 15, 19] colors = ["yellowgreen", "gold", "lightskyblue", "lightcoral","red", "purple", "#f280de", "orange", "green"] explode = (0,0,0,0,0,0,0,0,0.1) plt.pie(sizes, explode=explode, labels=labels, autopct="%1.1f%%",colors=colors) plt.axis("equal") plt.show()box chart scatter 散點圖
散點圖是同一組研究對象的兩個變量間關(guān)系的可視化
import numpy as np import pandas as pd import seaborn as sns import matplotlib.pyplot as plt students = pd.read_csv("data/ucdavis.csv") g = sns.FacetGrid(students, palette="Set10",size=7) g.map(plt.scatter, "momheight", "height",s=140, linewidth=.7,edgecolor = "#ffad40",color="#ff8000") g.set_axis_labels("Mothers Heilsght", "Students Height") plt.show()
散點圖最適合研究不同變量之間的關(guān)系:
男性與女性人群中不同年齡階段得皮膚病的可能性
IQ測試得分和GPA之間的相關(guān)性
另外我們還要考慮:
添加一條趨勢線或最佳擬合線(如果關(guān)系是線性的):添加趨勢線可以展示數(shù)據(jù)之間的關(guān)聯(lián)性
使用信息標(biāo)記類型:信息標(biāo)記類型適用于通過形狀和顏色提高視覺效果來解讀數(shù)據(jù)的情況
氣泡圖氣泡圖展示了數(shù)據(jù)的三個維度,每個數(shù)據(jù)點有三重維度(a, b , c), xy軸的坐標(biāo)表示兩個維度變量,氣泡的大小表示第三個維度的定量測度結(jié)果
Histograms直方圖直方圖(Histogram)又稱質(zhì)量分布圖。是一種統(tǒng)計報告圖,由一系列高度不等的縱向條紋或線段表示數(shù)據(jù)分布的情況。 一般用橫軸表示數(shù)據(jù)類型,縱軸表示分布情況。
import numpy as np import pandas as pd from scipy import stats, integrate import matplotlib.pyplot as plt #導(dǎo)入 import seaborn as sns sns.set(color_codes=True)#導(dǎo)入seaborn包設(shè)定顏色 np.random.seed(sum(map(ord, "distributions"))) x = np.random.normal(size=100) sns.distplot(x, kde=False, rug=True);#kde=False關(guān)閉核密度分布,rug表示在x軸上每個觀測上生成的小細(xì)條(邊際毛毯) plt.show()
當(dāng)繪制直方圖時,你最需要確定的參數(shù)是矩形條的數(shù)目以及如何放置它們。利用bins可以方便設(shè)置矩形條的數(shù)量。如下所示:
sns.distplot(x, bins=20, kde=False, rug=True);#設(shè)置了20個矩形條核密度估計圖
核密度估計(Kernel Density Estimation, KDE)是一種用來估計概率密度函數(shù)的非參數(shù)方法??梢酝ㄟ^觀測到的數(shù)據(jù)點取平均實現(xiàn)平滑逼近。
核密度估計是在概率論中用來估計未知的密度函數(shù),屬于非參數(shù)檢驗方法之一。.由于核密度估計方法不利用有關(guān)數(shù)據(jù)分布的先驗知識,對數(shù)據(jù)分布不附加任何假定,是一種從數(shù)據(jù)樣本本身出發(fā)研究數(shù)據(jù)分布特征的方法,因而,在統(tǒng)計學(xué)理論和應(yīng)用領(lǐng)域均受到高度的重視。
核密度函數(shù)與直方圖密切相關(guān),但有時能夠通過核概念用平滑性或連續(xù)性賦予實際含義。
概率密度函數(shù)(Probablity Density Function,PDF)的核是PDF的形式。這種形式不考慮非變量函數(shù)因素。
這里我們用一個鳶尾花數(shù)據(jù)集和seaborn包展示KDE圖
使用seaborn 和matplotlib演示KDE圖
seaborn.distplot
This function combines the matplotlib hist function (with automatic calculation of a good default bin size) with the seaborn kdeplot() and rugplot() functions. It can also fit scipy.stats distributions and plot the estimated PDF over the data.
seaborn的displot()集合了matplotlib的hist()與核函數(shù)估計kdeplot的功能,增加了rugplot分布觀測條顯示與利用scipy庫fit擬合參數(shù)分布的新穎用途。具體用法如下:
seaborn入門(一):distplot與kdeplot
seaborn.kdeplot
distplot()
distplot 函數(shù)默認(rèn)同時繪制直方圖和KDE(核密度圖)
from numpy.random import randn import matplotlib as mpl import seaborn as sns import matplotlib.pyplot as plt #引入鳶尾花數(shù)據(jù)集 df_iris = sns.load_dataset("iris") fig, axes = plt.subplots(1,2) # print(df_iris["petal_length"]) # print(axes[0]) # distplot 函數(shù)默認(rèn)同時繪制直方圖和KDE(核密度圖),開啟rug細(xì)條 sns.distplot(df_iris["petal_length"], ax= axes[0], rug = True) # shade 陰影 sns.kdeplot(df_iris["petal_length"], ax = axes[1], shade = True) plt.show()
如果不需要核密度圖,可以將kde參數(shù)設(shè)置成False。
sns.distplot(df_iris["petal_length"], ax= axes[0], kde = False, rug = True)
如果不需要核密度圖,可以將hist參數(shù)設(shè)置成False。
sns.distplot(df_iris["petal_length"], ax= axes[0], hist = False, rug = True)
# Fitting parametric distributions擬合參數(shù)分布 # 可以利用distplot() 把數(shù)據(jù)擬合成參數(shù)分布的圖形并且觀察它們之間的差距,再運(yùn)用fit來進(jìn)行參數(shù)控制。 import numpy as np import seaborn as sns import matplotlib.pyplot as plt sns.set(style="white", palette="muted", color_codes=True) rs = np.random.RandomState(10) # Set up the matplotlib figure f, axes = plt.subplots(2, 2, figsize=(7, 7), sharex=True) sns.despine(left=True) #引入鳶尾花數(shù)據(jù)集 df_iris = sns.load_dataset("iris") # Plot a simple histogram with binsize determined automatically sns.distplot(df_iris["petal_length"], ax= axes[0, 0], kde = False, color="b") # Plot a kernel density estimate and rug plot sns.distplot(df_iris["petal_length"], ax= axes[0, 1], kde = False, color="r", rug=True) # Plot a filled kernel density estimate sns.distplot(df_iris["petal_length"], ax= axes[1, 0], hist = False, color="g", kde_kws={"shade": True}) # Plot a historgram and kernel density estimate sns.distplot(df_iris["petal_length"], color="m", ax=axes[1, 1]) plt.setp(axes, yticks=[]) plt.tight_layout() plt.show()Fitting parametric distributions擬合參數(shù)分布
使用Scipy和Numpy演示KDE圖
我們用Scipy 和 Numpy表明概率密度函數(shù)
首先用Scipy中的norm()創(chuàng)建正態(tài)分布樣本
然后用Numpy中的hstack()進(jìn)行水平方向上的堆疊
再用Scipy中的gaussian_kde()
from scipy.stats.kde import gaussian_kde from scipy.stats import norm from numpy import linspace, hstack import matplotlib.pyplot as plt from matplotlib.pylab import plot,show, hist sample1 = norm.rvs(loc=-0.1,scale=1,size=320) sample2 = norm.rvs(loc=2.0,scale=0.6,size=130) sample = hstack([sample1,sample2]) probDensityFun = gaussian_kde(sample) plt.title("KDE Demonstration using Scipy and Numpy",fontsize=20) x = linspace(-5,5,200) plot(x,probDensityFun(x),"r") hist(sample,normed=1,alpha=0.45,color="purple") show()
利用kdeplot探索某大學(xué)學(xué)生消費(fèi)習(xí)慣與助學(xué)金獲得關(guān)系表面三維圖 常見案例 Ebola案例 體育案例 美國死亡率 金融與統(tǒng)計模型 統(tǒng)計與機(jī)器學(xué)習(xí) 生物信息學(xué)、遺傳學(xué)與網(wǎng)絡(luò)模型 高級可視化
數(shù)據(jù)集如下所示:
更多內(nèi)容可好看白鯨魚的另一個學(xué)習(xí)記錄:
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Python數(shù)據(jù)可視化-seaborn
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摘要:貢獻(xiàn)者飛龍版本最近總是有人問我,把這些資料看完一遍要用多長時間,如果你一本書一本書看的話,的確要用很長時間。為了方便大家,我就把每本書的章節(jié)拆開,再按照知識點合并,手動整理了這個知識樹。 Special Sponsors showImg(https://segmentfault.com/img/remote/1460000018907426?w=1760&h=200); 貢獻(xiàn)者:飛龍版...
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摘要:是你學(xué)習(xí)從入門到專家必備的學(xué)習(xí)路線和優(yōu)質(zhì)學(xué)習(xí)資源。的數(shù)學(xué)基礎(chǔ)最主要是高等數(shù)學(xué)線性代數(shù)概率論與數(shù)理統(tǒng)計三門課程,這三門課程是本科必修的。其作為機(jī)器學(xué)習(xí)的入門和進(jìn)階資料非常適合。書籍介紹深度學(xué)習(xí)通常又被稱為花書,深度學(xué)習(xí)領(lǐng)域最經(jīng)典的暢銷書。 showImg(https://segmentfault.com/img/remote/1460000019011569); 【導(dǎo)讀】本文由知名開源平...
內(nèi)置序列 容器序列 list, tuple, collections.deque等這些序列能存放不同類型的數(shù)據(jù) 扁平序列 str, byte, bytearray, memoryview, array.array, 這些序列只能容納一種類型數(shù)據(jù) 以上,容器序列存放的是他們所含任意類型對象的引用,而扁平序列存放的是值而不是引用 列表(list)是最基礎(chǔ)也是最重要的序列類型 列表推導(dǎo) >>> symb...
摘要:值得一提的是每篇文章都是我用心整理的,編者一貫堅持使用通俗形象的語言給我的讀者朋友們講解機(jī)器學(xué)習(xí)深度學(xué)習(xí)的各個知識點。今天,紅色石頭特此將以前所有的原創(chuàng)文章整理出來,組成一個比較合理完整的機(jī)器學(xué)習(xí)深度學(xué)習(xí)的學(xué)習(xí)路線圖,希望能夠幫助到大家。 一年多來,公眾號【AI有道】已經(jīng)發(fā)布了 140+ 的原創(chuàng)文章了。內(nèi)容涉及林軒田機(jī)器學(xué)習(xí)課程筆記、吳恩達(dá) deeplearning.ai 課程筆記、機(jī)...
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