什么是BLAST?

3119555200 發(fā)布于2022-08-02 08:01 / 1505人閱讀

摘要：是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館的注冊(cè)商標(biāo)。是生物信息學(xué)常用的工具軟件，可將輸入的核酸或蛋白質(zhì)序列與數(shù)據(jù)庫中的已知序列進(jìn)行比對(duì)，獲得序列相似度等信息，從而判斷序列的來源或進(jìn)化關(guān)系。

BLAST是由NCBT開發(fā)的一款多平臺(tái)服務(wù)軟件，它的全稱叫做Basic Local Alignment Search Tool，即“基于局部比對(duì)算法的搜索工具”，是由美國國家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information，NCBI)開發(fā)和管理的一套生物大分子一級(jí)結(jié)構(gòu)序列比對(duì)程序。"BLAST"是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(U.S. National Library of Medicine)的注冊(cè)商標(biāo)。

BLAST是生物信息學(xué)常用的工具軟件，可將輸入的核酸或蛋白質(zhì)序列與數(shù)據(jù)庫中的已知序列進(jìn)行比對(duì)，獲得序列相似度等信息，從而判斷序列的來源或進(jìn)化關(guān)系。

BLAST即基于局部序列比對(duì)算法的搜索工具。BLAST程序有在線版亦有本地版。在線版可將輸入序列與龐大的已知來源序列信息庫進(jìn)行比對(duì)，一般用于確定未知序列的來源，以及尋找不同物種中的同源基因;本地版是將輸入序列與本地自行構(gòu)建的序列信息庫進(jìn)行比對(duì)，比對(duì)的針對(duì)性更強(qiáng)，常用于在未發(fā)表基因組數(shù)據(jù)庫中尋找同源基因信息，不依賴于網(wǎng)絡(luò)，安全性和可靠性更高。

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